En un abrir y cerrar de ojos, treinta mil jugadores japoneses desconcertados son sacados de su vida cotidiana y llevados al mundo del popular MMORPG, Elder Tale, después de la última actualización del juego, sin poder cerrar sesión. Entre ellos se encuentra el estudiante universitario socialmente torpe Shiroe, cuya confusión y conmoción duran solo un momento cuando, como veterano del juego, se dispone de inmediato a explorar los límites de su nueva realidad.
Shiroe debe aprender a vivir en este nuevo mundo, liderando a otros y negociando con los NPC «nativos» para traer estabilidad a la ciudad virtual de Akihabara. A él se le unen su desafortunado amigo Naotsugu, que se ha conectado por primera vez en años y se encuentra atrapado, y Akatsuki, un asesino pequeño pero feroz que etiqueta a Shiroe como su maestro. Log Horizon, una historia de fantasía, aventura y política, explora los elementos del juego a través de los ojos de un estratega maestro que intenta sacar lo mejor de una situación desconcertante.