Jim Hawkins, un muchacho de quince años, lleva una vida tranquila con su madre en una ciudad portuaria. Todas las noches lee libros sobre las aventuras de varios piratas y enormes tesoros escondidos por el espacio. Un día, se topa con un hombre gravemente herido al que no puede salvar de una muerte segura. El hombre, llamado Billy Bones, le confía un precioso orbe que contiene un mapa que conduce a un fabuloso tesoro pirata, el legendario “Botín de los Mil Mundos”. El doctor Doppler organiza rápidamente una expedición a bordo del “RLS Legacy”, un magnífico galeón espacial. Jim emprende este fantástico viaje como grumete, pero gracias a los buenos consejos de su amigo John Silver, el carismático cocinero cíborg del navío, el muchacho se convierte en un experto navegante. Junto a los demás miembros de la tripulación, Jim se enfrentará a supernovas, agujeros negros y terribles tempestades cósmicas, pero pronto descubrirá que su viejo amigo Silver es en realidad un pirata que está planeando un motín.