Misaka, una de las 7 personas más fuertes de su escuela, es el personaje principal de la historia y puede controlar los campos eléctricos que la rodean. Vive en Ciudad Academia, una ‘ciudad científica del futuro’ con más de 2 millones de estudiantes que aprenden a controlar sus poderes esper (sobrenaturales), de los cuales algunos son más poderosos que otros. En su mayoría trata de hacer lo correcto, pero no está por encima de tomar el asunto en sus propias manos y doblar algunas reglas aquí y allá. Se trata de sus pruebas, tribulaciones y experiencias a medida que crece rodeada de sus amigos. Esta historia trata sobre ‘Level Upper’, un truco que la gente puede usar para volverse más poderosa rápidamente sin esfuerzo. Toaru Kagaku no Railgun es una ‘historia paralela’ completamente formada de Toaru Majutsu no Index donde un personaje secundario allí (Misaka) recibe su propia historia y punto de vista completos mientras interactúa con los eventos concurrentes de Index 1.