Naruto y sus amigos logran descifrar el código que Jiraiya dejó atrás, pero no es suficiente para resolver el misterio de Pain. Para Naruto, la muerte de Jiraiya es más que suficiente para inspirarle a seguir a Fukasaku hasta el Monte Myoboku, donde comienza su entrenamiento en Jutsu Sabio. ¿Pero será capaz el inquieto Naruto de quedarse quieto el tiempo suficiente para alcanzar el Modo Sabio? De vuelta en la Aldea de la Hoja, ocurre un desastre cuando los Seis Caminos del Dolor atacan la aldea, y los más queridos de Naruto son lanzados al caos de la batalla.