Peter Parker es un estudiante nuevo en el instituto Horizon de Nueva York,, al que una araña pica produciéndole una mutación genética que le dará habilidades. El estudiante, ahora tendrá un alter ego: Spider-Man, un superhéroe que se enfrentará a los peores villanos de la gran ciudad.

Peter Parker tendrá que averiguar como compaginar su vida en el instituto y sus batallas, y equilibrar la diversión y las responsabilidades. El adolescente-superhéroe, también recibirá ayuda en ciertas ocasiones como la de Ms. Marvel en una investigación del comportamiento extraño de los estudiantes de un internado. Entre los villanos encontramos a clásicos de los cómics Marvel como Doctor Octopus, Venom o Mysterio.