Libre de sospecha finalmente, Bones se reúne nuevamente con Booth (David Boreanaz). A pesar de que siguen resolviendo los más desafiantes casos, el malvado Christopher Pelant continúa con su conducta asesina, acercándose cada vez más a Bones y Booth. Resolviendo la desaparición de una famosa corredora de “derby sobre patines”, descubriendo a una víctima del 11S desaparecida hasta entonces, y poniendo fin a una peligrosa pandemia, Bones y su equipo resuelven una sucesión de extraordinarios casos. Mientras, Booth se enfrenta a los retos que le brinda la paternidad y su peculiar relación con Bones y por si no fuera suficiente, su madre reaparece después de 24 años sin tener noticias de ella y todo ello sumado a las impactantes noticias que recibirá sobre algunos de sus colegas de trabajo.